◆ 次世代シーケンサー対応機能

● ゲノムマッピング

次世代シーケンサーからの断片配列 (FASTA、FASTQ、FNA/QUAL、CSFASTA) を既知のゲノム配列 (参照配列) にマッピングします。

● SAM / BAM インポート

マッピング等の解析で一般的に使われる SAM / BAM 形式のファイルを読み込んで、ゲノムマッピングの結果と同時に表示します。

● 変異表

ゲノムマッピングによって得られたコンセンサス配列と参照配列を比較して、その変異を一覧表示します。変異表は印刷や CSV 形式でのファイルで出力できます。

● de novo アセンブリ

Forge (http://combiol.org/forge/) を使用して、次世代シーケンサーからの断片配列 (FASTQ、FNA/QUAL、CSFASTA) の de novo アセンブリを行います。

◆ シーケンサー出力のアセンブル

● 編集画面・結合マップ・波形表示の連動

編集画面に連動して結合マップと波形表示がスクロールするので、波形を確認しながらの編集作業が効率よく行えます。

● コンティグ全体の波形印刷

アライメントした状態での断片配列の波形データをコンティグ全体にわたって印刷できます。

● 比較要約表示

コンセンサス配列と断片配列が異なる部分だけを要約して表示します。波形表示と連動するのでベースコールを素早く評価できます。

● ベクター配列のトリミング

ベクター配列を検索して、断片配列を読み込む際にその部分を取り除きます。目的の塩基配列のみをアセンブルすることができます。

● アミノ酸翻訳表示

コンセンサス配列からアミノ酸へ翻訳して、コンセンサス配列と同時に表示できます。

●印は Ver.7 で新規追加された機能です。